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检测产品-SSR分型检测

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         SSR(simple sequence repeat)标记即简单序列重复,也称为微卫星DNA(Microsatellite DNA),一般是由26个核苷酸为重复单位(基序,motif)组成的长达几十个核苷酸的串联重复序列,如(AT)n(GCA)n等,其中n表示重复次数,其在同一物种不同基因型品种间的差异较大,并造成SSR长度多态性。

      新葡萄京娱乐场官方网站农业项目部为用户提供系统的SSR分型检测服务。包括SSR引物开发,引物筛选和样本批量检测,遗传学分析等。专业的团队和先进的技术,使SSR分型结果更精确、更可靠。

 

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检测原理及流程

 SSR位点两端多是保守的单拷贝序列,因此,可用两侧的保守序列开发特异PCR引物,并通过PCR和毛细管电泳(或凝胶电泳)技术,显示SSR位点在品种/个体间的多态性。

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技术优势  

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经典案例

Fingerprinting 128 Chinese clonal tea cultivars using SSR markers provides new insights into their pedigree relationships

      本研究中,研究者利用30SSR标记分析了128份优良茶树品种,筛选一组表现良好的SSR标记,并检验它们在指纹鉴别C. sinensis中的效果;为中国优良克隆茶品种首次创建一个基于SSR的指纹数据库,识别它们之间的亲代-子代(PO)关系。结果每个位点平均等位基因数有10.4个,平均多态信息含量为0.704,具有高度多态性。展示了强大的指纹识别能力,可能通过四种标记物的组合完全区分所有128个品种,在30个位点中找到具有相同基因型的两个随机个体的可能性估计为4.8×10-33。研究者进一步挑选出8SSR作为茶叶指纹鉴定的核心标记组。同时,基于指纹数据的亲缘分析揭示了47对假定的PO关系,其中33个与已知的谱系信息一致,其他14个在本研究中被鉴定。本研究所报道的SSR标记和谱系关系对于茶品种鉴定和新的育种计划很有价值。

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基于Nei's遗传距离的128个克隆茶品种的无根邻接(NJ)系统发育树依据谱系(遗传背景)信息和地理距离进行分组

样本要求 

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